المقررات الدراسية
Biodepollution and Advanced Microbial Biotechnology
The module “Biodepollution and Microbial Biotechnologies” focuses on the use of microorganisms and microbial processes to control environmental pollution and develop sustainable biotechnological solutions. It introduces the principles of bioremediation, the interactions between microorganisms and pollutants, and the microbial mechanisms involved in pollutant degradation and transformation. The module also explores bioremediation strategies and their applications in the treatment of contaminated soil, water, and air, highlighting the contribution of microbial biotechnologies to environmental protection and sustainable development.
Métabolisme secondaire et applications biotechnologiques
Ce cours est destiné aux étudiants de Master 2 Microbiologie fondamentale, vise à approfondir les connaissances relatives à la biosynthèse, à la régulation et à la diversité des métabolites secondaires produits par les micro-organismes, les plantes et les champignons. Il aborde les principales classes de ces composés bioactifs, ainsi que les techniques d’extraction, de purification, de caractérisation et d’analyse.
Une attention particulière est accordée aux applications biotechnologiques des métabolites secondaires dans les domaines pharmaceutique, agroalimentaire et environnemental, notamment la production d’antibiotiques, l’étude des mycotoxines et la valorisation des substances naturelles. Le module traite également de l’ingénierie métabolique et de l’optimisation des bioprocédés, afin de développer les compétences scientifiques et techniques nécessaires à la valorisation des ressources biologiques et à la maîtrise des procédés de production.
Omics et évolution des micro-organismes
Ce cours présente les approches omiques appliquées aux micro-organismes, du gène au phénotype, en passant par le génome, le transcriptome, le protéome et le métabolome. Il explique ce que chaque niveau d’information apporte, quelles technologies permettent de le mesurer (séquençage Sanger, Illumina, PacBio et Oxford Nanopore, spectrométrie de masse, RMN) et comment analyser, comparer et interpréter les données, de l’assemblage d’un génome à l’étude des microbiomes. Chaque chapitre est complété par des travaux pratiques de bioinformatique.