Le TP de taxonomie bactérienne destiné aux étudiants de L3 Biotechnologie microbienne couvre la classification des bactéries par l'étude de leurs caractéristiques phénotypiques (morphologie des colonies, coloration de Gram, forme, etc.) et génotypiques (séquençage de l'ARNr 16S). Les étudiants doivent aussi savoir utiliser des milieux de culture sélectifs pour isoler des bactéries spécifiques, les observer au microscope et utiliser des tests biochimiques pour les identifier. L'objectif est de les classer dans la hiérarchie taxonomique (Règne, Phylum, Classe, etc.) à l'aide d'une approche polyphasique.