• La capside :

C'est une coque protéique qui entoure et protège l'acide nucléique viral. Elle est constituée d'un assemblage de sous-unités répétées (appelées auparavant "capsomères", appelées actuellement "unités de structure" ou "unités morphologiques").
L'ensemble génome + capside constitue :

• Le virion des virus non enveloppés,
• La nucléocapside des virus enveloppés (dans ce cas, virion = nucléocapside + enveloppe).

• Assemblage des unités de structure
• Structure primaire des protéines : assurée par des liaisons covalentes, peptidiques.
• Structures secondaire et tertiaire (structure tridimensionnelle) : assemblage des protéines en sous-unités et assemblage des sous-unités en capside : assurées par des liaisons non covalentes, polaires (liaison hydrogène) ou non polaires (forces de Van der Waals et interactions hydrophobes).

 Les types de symétrie

La capside est constituée par la répétition d'une seule ou de quelques sous-unités protéiques. L'assemblage par répétition implique un arrangement symétrique. I1 existe deux types principaux de symétrie:

• Symétrie icosaédrique (= cubique)

L'icosaèdre est un polyèdre régulier présentant 12 sommets, 20 faces qui sont des triangles équilatéraux, et 30 arêtes. Il constitue une "boîte creuse" contenant l'acide nucléique.

• Symétrie hélicoïdale

Elle est caractérisée par la disposition en hélice des unités structurales autour du génome. Elle est décrite par le nombre d'unités par tour d'hélice et 1a hauteur du pas de vis.

Exemple 1 : virus de la mosaïque du tabac (TMV)

Ex 2 : virus de la grippe.

NB: chez certains bactériophages (virus infectant les bactéries), il existe une symétrie combinée associant une partie icosaédrique (tête) et une partie hélicoïdale (queue) et des structures particulières supplémentaires.

• L'enveloppe

Elle représente un deuxième critère de classification.

• Elle est constituée d'une couche bilaminaire lipidique et de protéines glycosylées ou non (nature lipido-glucido-protéique). Les unités structurales sont les péplomères.

Le contenu en lipides confère aux virus enveloppés une sensibilité aux détergents, sels biliaires, agents tensio-actifs (éther), à la chaleur. Les virus enveloppés sont donc des virus fragiles qui seront transmis par contact direct entre individus.
 L'enveloppe a de nombreuses fonctions:

• morphologique
• antigénique
• hémagglutinante
• enzymatique
• site d'attachement au récepteur cellulaire.

Exemple de virus à symétrie hélicoïdale enveloppé: virus de la grippe (Orthomyxovirus)