TP Ecologie microbienne
Résumé général des TP d’écologie microbienne
Ces travaux pratiques visent à initier les étudiants à l’isolement, la culture, la production et l’évaluation biologique des métabolites secondaires produits par les actinobactéries, un groupe de bactéries du sol reconnues pour leur rôle dans la production d’antibiotiques et autres composés bioactifs.
TD Physiologie cellulaire et moléculaire des microorganismes
Description des Travaux Dirigés (TD)
Module : Physiologie cellulaire et moléculaire des microorganismes
Niveau : Master 1 – Microbiologie fondamentale
Les travaux dirigés (TD) de ce module ont pour objectif de renforcer les connaissances théoriques à travers des analyses, études de cas et exercices d’application relatifs à la physiologie et la biologie moléculaire microbienne. Ils permettent aux étudiants de comprendre les mécanismes cellulaires des microorganismes et d’interpréter des données expérimentales issues de la recherche microbiologique.
Objectifs pédagogiques
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Comprendre et expliquer les mécanismes de communication bactérienne (quorum sensing) et de formation de biofilms.
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Analyser des résultats expérimentaux sur la résistance aux antibiotiques et les réponses au stress.
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Interpréter des schémas et données moléculaires sur le système CRISPR-Cas et les bactériocines.
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Développer la capacité à relier les phénomènes moléculaires (expression génétique, régulation, signaux chimiques) aux phénomènes physiologiques observables.
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Favoriser la réflexion critique et la démarche scientifique à travers des questions dirigées et des mini-projets.
Contenu proposé des séances de TD
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Étude d’un biofilm bactérien : structure, étapes de formation, et mécanismes de résistance.
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Analyse du quorum sensing : molécules signalisatrices, exemples de régulation génique.
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Schématisation et annotation d’une biomembrane bactérienne.
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Étude de cas sur l’antibiorésistance : interprétation de données expérimentales (tests de sensibilité, pompes d’efflux).
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Exercice sur le système CRISPR-Cas : fonctionnement, applications biotechnologiques.
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Comparaison des bactériocines et discussion sur leurs applications.
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Analyse des mécanismes d’adaptation à différents stress (température, pH, osmolarité, oxydation).
Méthodes pédagogiques
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Études de documents scientifiques et d’articles récents.
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Travaux en groupe et discussions guidées.
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Interprétation de résultats de recherche.
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Présentation orale ou écrite des analyses réalisées.
Compétences acquises
À la fin des TD, l’étudiant saura :
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Analyser un phénomène microbien complexe à plusieurs échelles (moléculaire, cellulaire, écologique).
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Interpréter des données expérimentales issues de la microbiologie moderne.
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Expliquer les stratégies adaptatives et les interactions microbiennes.