Description des Travaux Dirigés (TD)

Module : Physiologie cellulaire et moléculaire des microorganismes

Niveau : Master 1 – Microbiologie fondamentale

Les travaux dirigés (TD) de ce module ont pour objectif de renforcer les connaissances théoriques à travers des analyses, études de cas et exercices d’application relatifs à la physiologie et la biologie moléculaire microbienne. Ils permettent aux étudiants de comprendre les mécanismes cellulaires des microorganismes et d’interpréter des données expérimentales issues de la recherche microbiologique.

Objectifs pédagogiques

• Comprendre et expliquer les mécanismes de communication bactérienne (quorum sensing) et de formation de biofilms.

• Analyser des résultats expérimentaux sur la résistance aux antibiotiques et les réponses au stress.

• Interpréter des schémas et données moléculaires sur le système CRISPR-Cas et les bactériocines.

• Développer la capacité à relier les phénomènes moléculaires (expression génétique, régulation, signaux chimiques) aux phénomènes physiologiques observables.

• Favoriser la réflexion critique et la démarche scientifique à travers des questions dirigées et des mini-projets.

Contenu proposé des séances de TD

1. Étude d’un biofilm bactérien : structure, étapes de formation, et mécanismes de résistance.

2. Analyse du quorum sensing : molécules signalisatrices, exemples de régulation génique.

3. Schématisation et annotation d’une biomembrane bactérienne.

4. Étude de cas sur l’antibiorésistance : interprétation de données expérimentales (tests de sensibilité, pompes d’efflux).

5. Exercice sur le système CRISPR-Cas : fonctionnement, applications biotechnologiques.

6. Comparaison des bactériocines et discussion sur leurs applications.

7. Analyse des mécanismes d’adaptation à différents stress (température, pH, osmolarité, oxydation).

Méthodes pédagogiques

• Études de documents scientifiques et d’articles récents.

• Travaux en groupe et discussions guidées.

• Interprétation de résultats de recherche.

• Présentation orale ou écrite des analyses réalisées.

Compétences acquises

À la fin des TD, l’étudiant saura :

• Analyser un phénomène microbien complexe à plusieurs échelles (moléculaire, cellulaire, écologique).

• Interpréter des données expérimentales issues de la microbiologie moderne.

• Expliquer les stratégies adaptatives et les interactions microbiennes.